发帖
每发1个新帖
可以获得0.5个丁当奖励
回帖

【交流】07原创：有问必答——Meta分析选题、写作、投稿交流专帖（Meta分析相关SCI发表经验回馈战友） [精华]

楼主

200750383

丁香园版主

+5 积分
1楼

这个帖子发布于5年零217天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

帖子主题：本人自学循证医学，对其有很浓厚的爱好和兴趣，希望和战友在这个帖子里面讨论meta分析的选题，文献检索，数据提取，统计分析，文章撰写，投稿，修稿，接受校对等问题，自己水平有限，但是有问必答，知无不言，言无不尽
学生于自学循证医学，不管自己水平咋样，有热情，有兴趣开此帖抛砖引玉，希望高手出击，多交流，共进步，自己水平有限，主要为对meta分析有兴趣的入门战友指点一二，欢迎来交流等

目前已在多个专业顶尖杂志发表循证类文章，包括Chest, Anesthesiology, Critical Care Medicine, Intensive Care Medicine, Crirical Care, CMAJ, JBJS

邀请讨论

搜索

2013-02-19 20:07 来自 Android客户端浏览 : 239760 回复 : 2711

投票 244
收藏 1515
打赏
引用
分享
- 微信扫一扫
- 新浪微博
- 丁香客
- 复制网址
举报
- 广告宣传推广
- 政治敏感、违法虚假信息
- 恶意灌水、重复发帖
- 违规侵权、站友争执
- 附件异常、链接失效
- 其他

200750383 编辑于 2018-02-28 08:02

• 丁香早知道-9.21 | 医生被男子深夜蹲点袭击暴打，这种情况如何保护自己？

收起全部有料回复

raymi

胃肠外科

丁香园准中级站友

+2 积分

热

554楼

taozi20037091
请教07兄，生存曲线不能做Meta分析，但是我们肿瘤的文章需要评价的主要指标就是生存指标，请问有

首先，谢谢 @200750383 的信任，@taozi20037091 战友，您好：

一、生存分析预后相关的meta文章，有2种指标：1. 二分类 2. HR（O-E and Variance），此种方法最理想，不过存在技术上的难度。
二、（1）假如你采取方法1，操作起来比较简单，但是涉及到一个脱落问题，一般以某某年死亡人数为指标（坏事件，标签位置不动），不过存在统计学上的缺陷，需要分别计算短期及长期的死亡人数，例如，1,3,5年时间截点时的死亡人数；
（2）假如你采取方法2，方法学上有优势，不过数据的提取问题比较复杂，假如文章里面有HR，最好（一般有多因素HR和单因素HR之分，一般多因素最好，没有，只能勉强用单因素，都有，可以行亚组分析）；没有的话，通过计算得来，也可以；实在没办法，你只能用Engauge软件自己提取（不过我发现这种方法当连续取点时候，有很多缺陷，见下面帖子里面我提到的缺陷问题）。不过HR的好处就是，不需要计算那么多时间截点，可以自己定义一个时间截点（根据临床经验，例如，胃癌定义5年的OS和PFS即可，要是分别计算一下3年及5年的OS+PFS 就更完美啦）。

三、友情提示：预后的文章，肿瘤复发是一个很重要的指标，一般最好在文章里面要有体现。

只是粗略回答你一下，另外，给你推荐一个帖子，关于生存分析的文章（看完基本可以明白了）。

http://ebm.dxy.cn/bbs/topic/24354568
http://ebm.dxy.cn/bbs/topic/24151615

1. 你用HR做指标，不需要分别作1,3，5年生存率了，只要时间最长的那年的HR即可，一般选取随访终点时的HR作为指标。这样HR代表的是整体的情况，而1年和3年HR作指标都是不合适的；
2. 另外，因为不同研究的随访截止时间不同，可能存在严重的临床异质性，因此，我个人倒是觉得，是否可以用5年HR作为outcome呢？（不同肿瘤的最有意义的cutoff或者不同，不过个别肿瘤一般是5年为比较有意义的cutoff，你研究的肿瘤是什么就不知道了。不过很多研究一般随访都在60-72个月左右，所以取5年（60个月），还是比较不错的）；
3. 假如不这样的话，也可以采用随访终点时间HR作指标，不过要是存在异质性，要进行合理的分析，或者进行亚组分析等等相关问题，同时注意，亚组分析增加了假阳性的概率，因此需要慎重。
4. 其他指标如95%CI, Ln(HR),SE(ln(HR))等指标可以计算的。可以将软件import as 一个excel表格的形式，然后有一个Excel统计计算表格，具体如何操作，请参照A版的经典帖子，里面说的很清楚，很明白，学习1-2天基本就会了，下面是地址；
http://ebm.dxy.cn/bbs/topic/24354568

下面是我为你整理出来我之前的回答，仅供参考：
第一：我研究的问题，基本纳入的研究，在5年以后实验组和干预组的生存曲线已经是平行的了，那么我是否只可以计算到5年的？因为多数研究曲线是只到5年的，有个别的研究到6年的（72个月），并且这几个研究的5年---6年曲线是平行的，我又必要还继续包含这段时间吗？这种情况的 5-yearOS/PFS HR有差异吗？假如有，差异大嘛？（此问题已经解决，完成可以只计算5年的HR，结果没有变化，具体验证过程见下面。）

第二：我发现了一个问题，假如在同一个横坐标上面取点，即使我事先在图中画一条竖线，穿越干预组和对照组，我描点的时候，无论我多么精确，这2个点理论上，应该在最终的excel生成1组数据，例如， 36,42.1%,24.1%; 然而，最终实际上却产生了2组数据，36, 42.3%, 24.2%； 36.01, 42.0%, 24.0%，这个问题如何解决呀？我希望做的是在同一个横坐标，只产生一组数据，这个误差倒是允许范围的，不过假如并没有事先画竖线，那么此时曲线A和曲线B的取点都具有随机性，上下曲线的取点问题更具有随机性，那么会产生更多多余的点，那么此时造成得误差可能要远远大于事先画竖线造成得误差，因此我觉得，必须要事前做竖线，然后尽量保证曲线A和B在同一个横坐标取点（结果假如是2组数据，这时候可以删除一组即可），不知道我的理解是否正确？大家有没有遇到这个问题呢？

第三：我想在生存曲线上面上一些竖线，有没有什么简单点的方法？可以我自己选择位置画竖线，这样我就可以在自己觉得拐点比较多的地方多取几个点，在相对变化不大，甚至是水平线的地方少取几个点，不过这样还是解决不了同一个竖线，2条曲线取点，最后产生2组数据的问题!

第一个问题：可能有微小的差别，计算HR需要用全所有的随访数据，最后一年虽然两者曲线平行，但有差别，而这个差别肯定会为总的HR作贡献，至于如何改变，你得自己试验一下，算到5年和6年各用一次，如果有差别，个人以为应以6年为准，随访完整，不然，你相当于是选择性报道了全面一部分数据，而后一部分弃之不用。而且，不同随访期的数据是可以合并的，所以还是用全数据的好。
结果分享一下哈

第二个问题：佩服兄弟的精益求精，但是这个问题恐怕是无法解决的，因为取点的时候是一个像素一个像素的移动，可以想象成以像素为单位的整数点移动，而软件更精确，36和36.01可能就是同一竖线上的点。
导致此结果还有个原因可能是：原始生存曲线图可能有点儿歪，旋转了一点点儿，就是x轴可能不是完全或者绝对水平，因为在photoshop等软件中旋转图像的时候也是以像素为单位改变，而不能连续改变。所以，即使画了竖线，但这条竖线和y轴不是绝对平行的，而在Enguagedigitizer中，（0,0），（100，0），（0,100）三个点取好后生成的X轴和y轴却是和原生存曲线图的x轴和y轴完全吻合（理论上），无论原始图如何歪。
这两个原因都可能导致同一竖线，在2条曲线上对应的是不同横坐标啦。

理论上的探讨：可以尝试举个例子，采用极限法假设：

1）假设实验组A和对照组B 从一开始到最终随访结束，没有任何一个人死亡，生存率从0-72个月均为100%，无论随访多长时间，2条曲线均是平行的，那么此时计算任何一年的HR和随访结尾年的HR必须是一致的；

2）同理，假如随访到5年以后，曲线开始平行，假如之后2组均没有死亡，一直保持平行，那么你曲线到6年，抑或100年，或许结果都没有变化，这就是一般作者在曲线平行以后只再随访1-2年的原因；

因此我觉得，曲线平行之后，可以不用再计算了，生存曲线的研究是微积分的原理，个人认为是累计曲线斜率微积分后的均值问题，平行以后，2条曲线的斜率为0，任凭如何微积分也是为0，对整体的斜率均值没有影响（胡诌的，呵呵。当娱乐了）

1）因为Excel 只有33个点可以用，这些点，我首先在所有拐点地方作图，在斜率变化大的地方作竖线，最后剩下的平均分配一下即可！

2）前辈，你的方法虽然密集，最终要进行人为的删减，这此时你是无法将Excel里面的点和曲线里面的拐点和切率变化大的地方像对应的（假如你没有事前画竖线的画，您只能靠肉眼了），这样看来，我的方法理论上是有更大优势大，优于连续取点的方法。连续取点虽然看起来特别密集，其实在excel里面进行认为删减那个步骤，却产生了更大的误差（我认为连续取点最大的误差在此处，而不在软件里面取点那步）。

版主水天之间留言:
非常有价值的帖子，内容丰富精炼

2013-03-17 23:46

投票 13
收藏 48
打赏
引用
分享
- 微信扫一扫
- 新浪微博
- 丁香客
- 复制网址
举报
- 广告宣传推广
- 政治敏感、违法虚假信息
- 恶意灌水、重复发帖
- 违规侵权、站友争执
- 附件异常、链接失效
- 其他

水天之间编辑于 2013-03-18 11:04

• 如何在基层医院治疗肾病综合征？

黑暗传说

骨科

丁香园准中级站友

热

135楼

pl781102
有几个困扰已久的问题请教楼主：
如何选择投稿杂志，杂志分高尽量还能中有技巧吗？据搞后修改能否投较原来高点的杂志？中几率大吗？
另外，对meta和RCT孰轻孰重，楼主怎么看？临床医生如何搞好科研？楼主有何见解？
找个沙发坐等楼主讲课，在下洗耳恭听，呵呵。谢谢。

07兄见解独到，学习了！

补充一个丁香园自己的资源：http://journal.pubmed.cn/

我说一下自己的习惯吧！我最常用的是一个大家更熟知的资源：web of science。只不过这个数据库是IP识别的，一般学校没有。但是，该资源的文献分析功能是pubmed等无法比拟的。这个功能在期刊选择方面尤为重要。我一般都是在这个数据库里面检索与自己写的文章主题相似的文章，然后分析这些文章发表在什么杂志上了，把可以考虑的前几名拿出来，然后去******、dxy搜索发表经验。如果觉得可以，就去看杂志的文章，权衡自己的文章水平和杂志的难度，然后确定投稿期刊。

2013-02-26 00:46

投票 5
收藏 35
打赏
引用
分享
- 微信扫一扫
- 新浪微博
- 丁香客
- 复制网址
举报
- 广告宣传推广
- 政治敏感、违法虚假信息
- 恶意灌水、重复发帖
- 违规侵权、站友争执
- 附件异常、链接失效
- 其他

• 关于执业医师成绩时间：已致电医考中心，10月中旬出成绩

raymi

胃肠外科

丁香园准中级站友

热

34楼

xiaochongchong
绝对是大牛，佩服。给您投一票。
我刚学，有很多幼稚的问题会问到您，别嫌烦哈。
第一个问题：您发了这么多篇SCI，是都能报销吗？还是有免费可以发表的？因为我也刚发了一篇不是meta的SCI,要了我1500 dollar，太贵了，经费有限呀！
第二个问题：我如果选中一个题目，国外相关的的有4~5篇随机对照研究，而国内的有几十篇（质量都不高），我能否语种直接选择英文排除国内的文献，这样是否增大了选择偏移？编辑接受这样的meta吗？

1）发文章，尤其是SCI文章，单位都会给报销的，一般都是1分报销上限10000左右。不需要走老师的经费，老师的经费可以留着报销类如论文编辑费，润色费那种单位不给报销的钱；
2）中国的RCT研究，一般实验的具体方法都很模糊，没有交待随机，盲法等一系列问题，因此质量是存在严重风险的，推荐没有十足的把握最好不用引用国内RCT研究，不是我对国人的RCT没信心，是国外审稿人对国人的RCT质疑太大了。因此只检索英文文献，不检索汉语文章，是可以的，或者你文章里面写检索了，实际却并不纳入，这样更好一些

2013-02-20 21:44

投票 6
收藏 7
打赏
引用
分享
- 微信扫一扫
- 新浪微博
- 丁香客
- 复制网址
举报
- 广告宣传推广
- 政治敏感、违法虚假信息
- 恶意灌水、重复发帖
- 违规侵权、站友争执
- 附件异常、链接失效
- 其他

raymi 编辑于 2013-02-20 21:46

• 如何在基层医院治疗肾病综合征？

循证医学

【交流】07原创：有问必答——Meta分析选题、写作、投稿交流专帖（Meta分析相关SCI发表经验回馈战友） [精华]

提示

丁香园旗下网站

关于丁香园

官方链接

循证医学

分享到：

微信扫一扫

【交流】07原创：有问必答——Meta分析选题、写作、投稿交流专帖（Meta分析相关SCI发表经验回馈战友） [精华]

微信扫一扫

微信扫一扫

微信扫一扫

微信扫一扫

提示

丁香园旗下网站

关于丁香园

官方链接