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盘点代谢组学碰到的那些问题

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楼主

代谢组学百问团

分子生物学实验室

常驻站友

225楼

dxy_ukcwnrm5
代谢通路怎么分析呢？

采用KEGG数据库或者metaboanalyst网站http://www.metaboanalyst.ca/进行分析。如想迅速掌握，建议来参加培训。

2018-04-09 19:01

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• 中年男性，体检发现左肾占位，典型病例，送分题，已公布病理。

楼主

代谢组学百问团

分子生物学实验室

常驻站友

226楼

藏地格桑
您好!请问这个软件上的enrichment analysis与pathway analysis有什么区别？做这两个分析的第二步要选择分析方法，有三种，其中Quantitative enrichment analysis能用于非靶向代谢组学的分析吗？
还是说非靶向代谢组学只能用第一种
谢谢老师！

一个是富集分析，一个是通路分析。

下面的选择项是根据你的数据来，有看一个样品的profile的，有看多组样品的，有单纯给化合物名称的，有除了名称还给表达量的。

建议您来参加我们 pathway及热力图培训，系统的学习一下。培训官网***

包学会，费用不贵。

2018-04-09 19:09

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dachong99 编辑于 2018-04-09 20:20

• 落枕诊治

入门站友

227楼

老师您好，我想请问：1.老师您有关脑组织前处理的方法么，做脑组织代谢的

2.如果用高效液相质谱做非靶向的话，用麻醉剂用什么比较好。我本来打算不用麻醉直接断头术取血，但是动物中心老师说太残忍，以后发文章不好发，建议我用

3.样本量如何确定？看文献大概是6-15只每组，我不知道如何判断多少样本才有统计学意义，您有什么建议么？

4.如果研究生期间做非靶向到靶向，人力财力物力大概如何计量

5.在非靶向阶段对代谢物定性，用高效液质的话，我是不是必须要标准品？如果要，标准品买哪些？靶向必须需要用mrm扫描么？

6.望老师有相关资料能分享给我做更多的了解，谢谢老师。

2018-04-14 23:15 来自 Android客户端

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入门站友

228楼

您好，我准备做植物方面的功能代谢组学，目前看到的文献都是关于动物模型的，请问在植物上目前有做功能代谢组学的相关推荐参考文献吗？

我们前面有人已经做过非靶标代谢物的分析了，我现在想主要分析某一个通路，但是刚开始，都还狠迷茫

2018-04-22 11:13

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