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生物信息

关注今日:5 | 主题:139826
论坛首页  >  生物信息学讨论版   >  NGS & Microarray
该话题已被锁定 - biozy , 2012-07-24 23:02
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请问同样的RNA样品做基因芯片,前后结果不一致,是什么原因呢?

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楼主 liwencock
liwencock
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这个帖子发布于8年零207天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
各位大侠,我三月份做长链非编码RNA的基因芯片*(包括表达谱),我做了两个样品,一个对照样品,一个处理样品,开始他们公司弄错了,帮我做了第一代的芯片,后面他们公司说不能退钱,一个月以后帮我重新做第二代的芯片,样品还是原来的两个RNA样品,第二次,他们就没有帮我检测RNA和cDNA质量,结果出来以后和第一次的结果差异很大,第一次检测基因表达水平升高两倍以上的基因中,不到5%的基因在第二次检测中有同样的趋势(都是升高),其他的要么没变,要不降低,长链非编码RNA的结果更糟糕。请问造成这个原因的到底是RNA样品降解的原因还是芯片质量的问题,或者是基因芯片是回收利用后背景高的原因呢?问他们公司一直没有答案,特来求助各位大虾,谢谢。
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2012-07-01 09:46 浏览 : 5566 回复 : 10
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liwencock 编辑于 2012-07-06 15:10
  • • 临床要不要去做超声,超声科待遇怎么样?
genetics_ccm
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做芯片还是要找靠谱的公司做,我也是做这行的,现在芯片市场鱼龙混杂,如果严格来做,不应该出现这种情况的,前期的质检是用什么做的质检?直接跑胶还是用Agilent 2100?定量用的什么?是nanodrop吗?中间的芯片有没有问题那就只有康成自己知道了,至于你说的重复利用的问题嘛,呵呵呵呵,康成是怎么给你解释的
2012-07-02 00:07
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genetics_ccm
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好点的芯片CV值(变异系数)一般不会高于10%的
2012-07-02 00:08
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jiandingzhe
jiandingzhe
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  • 4楼
RNA本身就敏感,然后芯片还对操作人员的技术很敏感。
2012-07-02 10:23
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