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【求助】在NCBI的dbSNP里如何查找某基因SNP位点的基因频率？

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楼主

fineww

常驻站友

1楼

这个帖子发布于9年零62天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已解决悬赏丁当:10

求助于下各位：

想查找一个已知基因上中国汉族人杂合度较高的SNP位点，已经在NCBI上的bdSNP位点上搜索出了所有SNP位点，点击位点的rs号进去只看到diversify哪里有CUE的等位基因频率，不知道哪里可以查到中国汉族人的等位基因频率呢？再请教一个很基础的问题（实在是以前没接触过遗传啊）：有个ss号到底是什么的编号呢？还有一个snp的好像对应着很多nm号，又是怎么回事呢？是不是指这个snp所在的基因编码了几种不同nm号得蛋白质的意思呢？

非常感谢各位老师的指教！

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2011-08-03 19:56 浏览 : 32354 回复 : 24

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hongfengye171

神经科

常驻站友

2楼

找到SNP的位置,或知道SNP的名称,在SNP中检索.

2011-08-03 21:56

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楼主

fineww

常驻站友

3楼

hongfengye171
找到SNP的位置,或知道SNP的名称,在SNP中检索.

snp是检索出来了的哈，但是想看中国汉族人在该位点的等位基因频率哈！

2011-08-03 23:25

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fustic

常驻站友

4楼

不知道哪里可以查到中国汉族人的等位基因频率呢？

HapMap 里有SNP的基因频率，但通常NCBI和HapMap是相连接的，如你提到的“diversity”，如果想知道汉人的基因频率，您需要留意“HCB” （Han Chinese in Beijing, China, ）representing one of the populations studied in the International HapMap project ( http://www.hapmap.org).

2011-08-04 09:46

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