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遗传发育

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论坛首页  >  遗传学与发育生物学讨论版   >  医学遗传学
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【求助】在NCBI的dbSNP里如何查找某基因SNP位点的基因频率?

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楼主 fineww
fineww
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这个帖子发布于9年零218天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
问题已解决悬赏丁当:10
求助于下各位:

想查找一个已知基因上中国汉族人杂合度较高的SNP位点,已经在NCBI上的bdSNP位点上搜索出了所有SNP位点,点击位点的rs号进去只看到diversify哪里有CUE的等位基因频率,不知道哪里可以查到中国汉族人的等位基因频率呢?再请教一个很基础的问题(实在是以前没接触过遗传啊):有个ss号到底是什么的编号呢?还有一个snp的好像对应着很多nm号,又是怎么回事呢?是不是指这个snp所在的基因编码了几种不同nm号得蛋白质的意思呢?

非常感谢各位老师的指教!
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2011-08-03 19:56 浏览 : 34123 回复 : 24
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hongfengye171
hongfengye171
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找到SNP的位置,或知道SNP的名称,在SNP中检索.
2011-08-03 21:56
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楼主 fineww
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hongfengye171
找到SNP的位置,或知道SNP的名称,在SNP中检索.


snp是检索出来了的哈,但是想看中国汉族人在该位点的等位基因频率哈!
2011-08-03 23:25
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fustic
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不知道哪里可以查到中国汉族人的等位基因频率呢?



HapMap 里有SNP的基因频率,但通常NCBI和HapMap是相连接的,如你提到的“diversity”,如果想知道汉人的基因频率,您需要留意“HCB” (Han Chinese in Beijing, China, )representing one of the populations studied in the International HapMap project ( http://www.hapmap.org).
2011-08-04 09:46
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