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计算机

关注今日：2 | 主题：293505
论坛首页  >  计算机与医学、生物学软件   >  疑难|故障
该话题已被移动 - sherring , 2010-11-17 17:31
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【求助】求教使用IPP软件进行骨组织形态学测量方法，谢谢！

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楼主 songbaggio
songbaggio
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这个帖子发布于10年零111天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我的课题部分内容是关于骨组织形态计量学测量，具体有骨体积分数、骨小梁数目、骨小梁间距、骨小梁厚度和骨小梁结节末端比值这5个常用指标。有以下几个问题请教各位老师，忘不吝赐教，谢谢！
1.标本制备后需不需要脱钙？上海九院的方法是不脱钙，应用硬组织切片机，但是这种方法成本太高，小弟需要切得片又比较多，经费肯定不够，所以准备用脱钙后染色的方法，请问这对测量结果有影响吗？
2.2000年左右的文献大多是应用半自动或全自动图像分析软件对染色图片进行分析，近3年的文献报道是用image professional plus6.0（IPP）来测量上述指标，对IPP软件的使用我看了园子里很多老师写的教程，受益匪浅，但是始终没有找到测量骨小梁指标的具体方法。所以这里向大家请教下应用IPP软件测量上述骨小梁指标的具体方法。
3. 如果不用IPP，还有其他的软件可以用于骨小梁指标的测量吗？谢谢！
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2010-10-11 17:07 浏览 : 15566 回复 : 72
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楼主 songbaggio
songbaggio
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  • 3楼
谢谢老师，刚才正在您的博客中学习！先上上述指标的意义，马上上图。
1.骨体积分数（%）（BV/TV,bone volume fraction）：单位mm内骨小梁体积占整个松质骨体积的百分数, 以%表示，在图像中其实就是骨小梁的面积占松质骨总面积的百分比。
2.骨小梁厚度（Tb.Th,trabecular thickness）：骨小梁本身的平均厚度 。
3.骨小梁数目（Tb.N,trabecular number）：单位mm内骨小梁个数 。
4.骨小梁间距（Tb.Sp,trabecular space）：相邻两个骨小梁之间的平均距离。
5.骨小梁节点末端比值（Nd/Tm,ratio of nodes to temini）：即骨小梁连接点数目和游离末端数目的比值，反应骨小梁的连接性，是反映骨小梁结构的稳定性重要指标。在一篇外文文献中定义为：所在显微镜视野中所有骨小梁连接点数目和骨小梁总数的比值。
2010-10-13 21:29
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楼主 songbaggio
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  • 4楼
绿线框的是骨小梁，红线框的是骨小梁间距。由于上述指标都是平均值，所以不是很明白具体该怎么测；而且我做的切片很多，一张一张的自己测一是怕误差大，二是工作量太大，很多文献都说使用image pro plus进行自动或半自动测定。还请老师多指教！
2010-10-13 21:48
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楼主 songbaggio
songbaggio
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  • 5楼
再上张宏观点的图：蓝色的条状物是许许多多的骨小梁，骨小梁之间白色的空隙是骨小梁间隙；红色的小圈是标识的骨小梁连接点，由于太多没有一一标出。
疑问：1.我该怎么告诉电脑哪些是骨小梁连接点，哪些又是骨小梁游离末端呢，颜色上又没有什么差别；
2.骨小梁的平均厚度该怎么测呢，文献上似乎还用到什么公式，不知道IPP软件能套用公式吗？
3.如果骨小梁平均厚度能测，我想用类似的方法应该能测出骨小梁平均间距；
4.骨体积分数是骨小梁面积和松质骨总面积的比值，这个指标我觉得还好测点，有一些思路；
5.骨小梁数目：我该怎么告诉电脑哪些是骨小梁呢？
问题太多了，谢谢！
2010-10-13 22:12
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