dxy logo
首页丁香园病例库全部版块
搜索
登录

【求助】关于连锁分析的数据

最后编辑于 2022-10-09 · IP 上海上海
1503 浏览
这个帖子发布于 14 年零 295 天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
最近做多点连锁分析,其中需要要dat的文件,对这个文件有几点特别疑惑,请各位大侠帮忙,如下例:
8 0 0 5 << NO. OF LOCI, RISK LOCUS, SEXLINKED (IF 1) PROGRAM
0 0.0 0.0 0 << MUT LOCUS, MUT MALE, MUT FEM, HAP FREQ (IF 1)
1 2 3 4 5 6 7 8
1 2 << AFFECTION, NO. OF ALLELES
0.99990000 0.00010000 << GENE FREQUENCIES
1 << NO. OF LIABILITY CLASSES
0 0.9000 0.9000 << PENETRANCES
3 6 << ALLELE NUMBERS, NO. OF ALLELES
0.16666 0.16660 0.16660 0.16660 0.16660 0.16700 << GENE FREQUENCIES
3 5 << ALLELE NUMBERS, NO. OF ALLELES
0.20000 0.20000 0.20000 0.20000 0.20000 << GENE FREQUENCIES
3 7 << ALLELE NUMBERS, NO. OF ALLELES
0.14280 0.14280 0.14280 0.14280 0.14280 0.14300 0.14300 << GENE FREQUENCIES
3 7 << ALLELE NUMBERS, NO. OF ALLELES
0.14280 0.14280 0.14280 0.14280 0.14280 0.14300 0.14300 << GENE FREQUENCIES
3 9 << ALLELE NUMBERS, NO. OF ALLELES
0.11110 0.11110 0.11110 0.11110 0.11110 0.11110 0.11110 0.11110 0.11120 << GENE FREQUENCIES
3 6 << ALLELE NUMBERS, NO. OF ALLELES
0.16660 0.16666 0.16660 0.16660 0.16660 0.16660 << GENE FREQUENCIES
3 5 << ALLELE NUMBERS, NO. OF ALLELES
0.20000 0.20000 0.20000 0.20000 0.20000 << GENE FREQUENCIES
0 0 << SEX DIFFERENCE, INTERFERENCE (IF 1 OR 2)
0.1000 0.1000 0.1000 0.1000 0.1000 0.1000 0.1000 << RECOMBINATION VALUES
1 0.10000 0.45000 << REC VARIED, INCREMENT, FINISHING VALUE
1.PENETRANCES 前面的三个数值 0 0.9000 0.9000 是怎么得来的?
2.GENE FREQUENCIES 的数据是根据自己的数据计算得出的还是只需要写上1/n(基因数)平均数即可?
3. RECOMBINATION VALUES 是怎么得来的?


























3 2 点赞

全部讨论(0)

默认最新
avatar
3
分享帖子
share-weibo分享到微博
share-weibo分享到微信
认证
返回顶部