【专题讨论】Western Blot前煮蛋白对结果真的没影响吗？

做western blot近两年了，虽然不敢说精通，但是掌握是应该的了。
以前，就对煮蛋白这一环节有点不理解，但是还是照做下来。
最近，闲着无聊，就想把以前的疑惑拿来验证一下，结果让我更加疑惑。
煮蛋白之前每组蛋白浓度均用分光光度计测定，然后加上样缓冲液、煮蛋白5分钟，接着根据测得的蛋白浓度上样，每孔蛋白含量一样。与以前不一样的是，我预留一孔加没经过煮沸这一环节的蛋白。最后按常规电泳、转膜、依次加一抗、二抗孵育，结果曝光的片子，没有煮的那孔β-actin条带灰度值明显比其他的大，而其他孔的灰度值基本一致。
这是什么原因呢？
我想了以下两个原因：
（1）煮沸组：离心管盖子松弛，导致部分蛋白蒸发。但是，表面来看，所有离心管盖子都是紧盖着的。由于已经加了上样缓冲液，考马斯亮蓝法已无法再测其蛋白浓度。不知是否还有其他方法测其蛋白浓度？
（2）煮沸可能破坏了蛋白的抗原性。
不知诸位高手有何意见和看法？