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水生生物学

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论坛首页  >  水生生物学&海洋生物学讨论版   >  基因组学
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鱼类SNP研究思路征集

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楼主 hlq850112
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这个帖子发布于12年零102天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
近年来国内水产育种工作开展的如火如荼,各种分子标记纷纷被开发并应用于鱼类育种工作中。SNP作为第三代分子标记近两年来也被国内水产研究人员应用于鱼类育种工作中,并取得了一定的成绩。但是,目前鱼类SNP研究工作存在的瓶颈是,大部分经济鱼类基因组尚未测序,因此寻找SNP必然需要走基因克隆的路线,导致工作量大,效率低,成本高。有没有高人能够想出一个方案来大通量的筛选SNP并应用于分型研究?如果能如此,将极大的推动国内水产分子辅助育种的发展。各位请提出自己的意见吧,期待您的高见!!
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2009-01-08 20:37 浏览 : 3225 回复 : 15
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楼主 hlq850112
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  • 8楼
请问你要找那么多SNP干什么?
连锁图谱没有,QTL没有定位,找个SNP进行关联分析后就拿去做分子辅助育种????

我们找SNP本来就是可以应用于连锁图谱构建啊。我对于育种是新手,我想问的是,现在分子辅助育种的策略是什么?难道一定非要等所有的图谱构建好了才能去育种吗?
2009-01-12 09:29
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楼主 hlq850112
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  • 19楼
我们实验室SNP也才刚刚起步,目前做的还是常见的候选基因筛选加关联分析的套路,也打算对有较显著关联的位点采用RT技术探讨其对靶基因表达的影响及家系鉴定,但总的来说还是一些零星的工作。
全基因组测序是不可能完成了,我们现在有一个设想,就是希望通过构建EST文库来提高筛选SNP 的效率,希望获得较多的位点并应用于图谱构建。但是对于如何筛选将来获得的SNP位点用于图谱尚有许多问题,有没有一些标准来筛选用于图谱构建的SNP?
对于遗传连锁图谱的构建本人还知道一点,而QTL定位,尤其是数量性状的QTL定位是在搞不明白,各位改领域的前辈能不能推荐一些书籍?我想这也是大多数刚接触这方面的人的共有问题。
2009-01-14 14:01
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