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关于D-LOOP区的一些问题

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楼主

2008feelkaka

常驻站友

1楼

这个帖子发布于12年零116天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

我要做鱼的线粒体D-Loop分子标记，在Gene Bank上没有找到现成的引物，想自己设计引物，查找此鱼的线粒体控制区DNA序列，发现用不同的拉丁文名称竟然找出不同的序列和长度，这是怎么回事啊？
PS:两种名称是一个鱼，在不同文献里作者叫的不一样。
还有，是不是同属鱼可以通用一对引物啊？
谢谢！

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2008-11-10 15:56 浏览 : 2259 回复 : 9

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• 上海市2021年2月CPC病例讨论（已揭秘）

dreamshaw

常驻站友

2楼

很正常，分子标记建议不要在这个区域吧。这个区域变异最多，变化最快。不一定很通用的

2008-11-11 23:00

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• 本周议题：你的科研压力都来自哪里？

楼主

2008feelkaka

常驻站友

3楼

但是用变异最多进化最快的mtDNA控制区做进化比较不是很合适吗？
难道我的课题使用的工具不对？
老板说这个分子标记还是满好做的，我也查过很多关于此标记的文献，发现用的最多的引物就是DL1和DH2引物，自己现在马上要P 了，引物还没有找到，急啊，还是谢谢dreamshaw战友的回帖，呵呵。

2008-11-12 10:45

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• 【心电旋律 27】青年男性心肌梗死背后的真凶！

jhsu627

常驻站友

+1 积分
4楼

你最好查找一些亲缘关系比较近的，尤其是同属的不同物种，对这些物种进行序列比较，依据两头保守序列，再设计引物，这样好一些。因为两头的序列比较保守，D-LOOP区域变异最大，设计的引物很难扩出，后面还会影响你的后期测序，请予以考虑！

2008-11-12 10:56

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