• 论坛首页
  • 我的丁香客
  • 找人
    查找好友
  • 更多
    丁香园
    丁香通
    丁香人才
    丁香会议
    丁香搜索
    丁香医生
    丁香无线
    丁香导航
    丁当铺
    文献求助
    医药数据库
    丁香诊所
    来问医生
登录 注册

遗传发育

关注今日:0 | 主题:69213
论坛首页  >  遗传学与发育生物学讨论版   >  数据分析
  • 发帖
    每发1个新帖
    可以获得0.5个丁当奖励
  • 回帖

分享到:

  • 微信

    微信扫一扫

  • 微博
  • 丁香客
  • 复制网址

【求助】连锁不平衡分析 [精华]

  • 只看楼主
  • 页码直达:
  • 直达末页
  • 图片模式
楼主 xxshc
xxshc
铁杆站友

  • 26
    积分
  • 13
    得票
  • 229
    丁当
  • 1楼
这个帖子发布于12年零218天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
我做的结果如下。仅分析了case的连锁不平衡情况。
148 controls & 100 cases observed
-------------------------------------
-------------------------------------
Linkage Disequilibrium tests

D': Site2
Site1  0.738


r2: Site2
Site1  0.529

-------------------------------------
但位点1不符合哈迪温格森平衡,那请问我的这两个位点属于连锁不平衡吗?
可与对照比,第一个位点没有意义,第二个位点有意义。

我做的结果如下。仅分析了case的连锁不平衡情况。
148 controls & 100 cases observed
-------------------------------------
-------------------------------------
Linkage Disequilibrium tests

D': Site2
Site1 0.738


r2: Site2
Site1 0.529

-------------------------------------
但位点1不符合哈迪温格森平衡,那请问我的这两个位点属于连锁不平衡吗?
可与对照比,第一个位点没有意义,第二个位点有意义。
最近几年来,分子遗传标记很热!所以其分析一直是很多人关心的问题!
查看了很多国内文献,错误很多!
园子里的相关问题也很多!
所以开此贴方便大家谈论,学习!
希望高手留下宝贵经验!希望初学者也把自己心得体会留下!
liyi3344520

  • 邀请讨论
  • 不知道邀请谁?试试他们

    换一换
2008-06-22 14:10 浏览 : 51844 回复 : 35
  • 投票
  • 收藏 106
  • 打赏
  • 引用
  • 分享
    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
liyi3344520 编辑于 2008-09-28 10:15
  • • 医院试工害怕被「白嫖」怎么办?究竟去还是不去?
bioyoung
bioyoung
铁杆站友

  • 10
    积分
  • 6
    得票
  • 121
    丁当
  • 2楼
这些东西是基于统计学的,因此,仅仅放一个数字是没有意义的,关键是和别的数据去比,只要和别的数据显著不同,就可以说这一区域或者这一组样本存在一些特别的东西,那么用什么做背景呢,可以是其他组的样本,如你的control,也可以是基因组或染色体或染色体区域的平均水平

另外,不符合HW平衡有很多原因,你也要具体分析
2008-06-23 08:19
  • 投票
  • 收藏
  • 打赏
  • 引用
  • 分享
    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
  • • 腹腔镜下乙状结肠癌根治术(NOSES IV 式)
楼主 xxshc
xxshc
铁杆站友

  • 26
    积分
  • 13
    得票
  • 229
    丁当
  • 3楼
bioyoung
这些东西是基于统计学的,因此,仅仅放一个数字是没有意义的,关键是和别的数据去比,只要和别的数据显著不同,就可以说这一区域或者这一组样本存在一些特别的东西,那么用什么做背景呢,可以是其他组的样本,如你的control,也可以是基因组或染色体或染色体区域的平均水平

另外,不符合HW平衡有很多原因,你也要具体分析


看不懂!因为是初次接触这方面的东西。能麻烦您讲得细点可以吗?另外,象这样的属于连锁不平衡吗?
2008-06-23 10:53
  • 投票
  • 收藏
  • 打赏
  • 引用
  • 分享
    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
  • • 酚酞片严重不良反应被禁用?你了解吗?
maxon
maxon
铁杆站友

  • 27
    积分
  • 38
    得票
  • 167
    丁当
  • 4楼
不算LD
2008-06-24 11:44
  • 投票
  • 收藏
  • 打赏
  • 引用
  • 分享
    • 微信扫一扫

    • 新浪微博
    • 丁香客
    • 复制网址
  • 举报
    • 广告宣传推广
    • 政治敏感、违法虚假信息
    • 恶意灌水、重复发帖
    • 违规侵权、站友争执
    • 附件异常、链接失效
    • 其他
  • • 临床要不要去做超声,超声科待遇怎么样?

关闭提示

需要2个丁当

丁香园旗下网站

  • 丁香园
  • 用药助手
  • 丁香通
  • 文献求助
  • 丁香人才
  • 丁香医生
  • 丁香导航
  • 丁香会议
  • 手机丁香园
  • 医药数据库

关于丁香园

  • 关于我们
  • 丁香园标志
  • 友情链接
  • 联系我们
  • 加盟丁香园
  • 版权声明
  • 资格证书

官方链接

  • 丁香志
  • 丁香园新浪微博
引用回复