【积分鼓励翻译】生物信息学用于改善人类疾病研究和疫苗开发

生物信息学用于改善人类疾病研究和疫苗开发
免疫反应，本质上是机体如何与引起疾病的因素作斗争，它是疫苗开发成功与否的关键因素。
国际知名的疫苗专家LIAI's Emerging Infectious Disease and Biodefense Center的领导人Alessandro Sette, Ph.D.说“我们已经证实它能准确成功地揭示多数抗原决定簇（标靶）会触发有效的免疫反应来对抗复杂的病原细菌”。“这实在令我们兴奋无比，因为这进一步证明生物信息学在诊断工具和最终疫苗的开发和运用上的重要作用”
生物信息学在科学界有十分重要的地位，因为它具有使科学研究更快发展并且比传统实验室试验研究花费更少的潜力
这个发现在本周的报刊上发表，“一个交感抗原决定簇的预测更容易鉴定鼠类TCD8+-细胞的宽度对痘苗病毒的反应”发表于自然生物技术杂志网络版，LIAI 科学家Magdalini Moutaftsi是这份报纸的主编。
生物信息学使用计算机数据库，数学算法和统计学技术来分析生物信息时，它已被用来预测免疫反应。LIAI小组的研究发现是至关重要的，因为他们的研究证实在非常复杂的病原体（即痘苗病毒）中有很高的预测准确性（95％）。痘苗病毒使用在牛痘苗时是无害的，因为它与作为传播天花媒介物的天花病毒相关。研究小组能够在动物试验中证实计算机测试结果的准确性。
“在此之前，我们知道我们的预测性方法是有成效的，但是这项研究证实预测的成效非常好，预测有着很高的准确性” Sette说。
研究人员的研究集中在检测主要组织相容性复合物（MHC）上，它能结合特定的抗原决定簇并且它是触发免疫系统攻击感染细胞的钥匙。当抗原决定簇开始免疫反应的时候，它们是身体免疫系统聚焦的病毒的一些片断。通过了解什么样的抗原决定簇会结合MHC分子并引起免疫反应，科学家就能利用这些抗原决定簇发展一种疫苗来避免疾病――正如刚才所说的天花。
科学家通过计算机模拟可以发现95％MHC结合的抗原决定簇。“这是第一次生物信息学对抗原决定簇MHC结合的预测，它可以解释几乎全部如牛痘苗般存在于非常复杂病原体中的抗原决定簇” LIAI的研究人员Magdalini Moutaftsi说。LIAI科学家理论上认为对抗原决定簇MHC结合的生物信息学预测方法同样适用于其他病毒。
“本试验所用病毒的优点是它是现存最为复杂的一种”庞大”的病毒” Moutafts说“假如我们能从这个大病毒中预测几乎全部的抗原决定簇，我们就可以容易预测结构不太复杂的病毒如流行性感冒病毒，疱疹病毒，甚至HIV病毒,最终将这种方法论使用于大的微生物如肺结核菌。
Sette解释，使用生物信息学预测免疫系统靶标的一个大优点是，它不需要在实验室里制造和检测大量的多肽来找出哪些会先开始免疫反应。 多肽是氨基酸片断，它有可能被免疫系统辨认。Sette解释说：“有着数以千计的多肽”， “你必须创造和检测其中的几百个甚至几千个来发现正确的多肽”。 他说“计算机使用生物信息学可以依据非常复杂的数学算法来筛，并且使用计算机相比在实验室检测可以花费更少的时间和金钱”。

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