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如何分析数据集中某个基因与临床参数表达的关系?

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楼主 Miem
Miem
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已知某个基因,想从数据库中进一步验证这个基因表达高低与临床参数的关系,应该怎么做呢?(结果如下表)

GEO数据库分析吗?可以教教怎么做吗

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2020-04-29 17:41 浏览 : 1321 回复 : 5
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翻开《卫生统计学》,单因素方差分析。。。

2020-05-01 11:14
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楼主 Miem
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翻开《卫生统计学》,单因素方差分析。。。


😂我可能没表述清楚,我想问的是如何从GEO下载一个dataset,然后怎么把dataset中的数据整理成类似这个表。不知道是否要用到R语言,您知道吗
2020-05-01 11:49 来自 Android客户端
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Miem
😂我可能没表述清楚,我想问的是如何从GEO下载一个dataset,然后怎么把dataset中的数据整理成类似这个表。不知道是否要用到R语言,您知道吗


GEO数据不一定有这些临床信息。

GEO官方只要求上传者必须上传样本信息(采样部位、分组情况、芯片数据),而不强制要求上传临床信息(性别、年龄、用药、TNM分期等)。


在有这些数据的前提下,如需要整理表格,可以使用R语言,也可以使用Excel、记事本等等你熟悉的文本处理软件。

我熟悉R语言,所以,我会使用R语言。

2020-05-01 13:02
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