已知某个基因,想从数据库中进一步验证这个基因表达高低与临床参数的关系,应该怎么做呢?(结果如下表)
GEO数据库分析吗?可以教教怎么做吗
不知道邀请谁?试试他们
翻开《卫生统计学》,单因素方差分析。。。
stringson翻开《卫生统计学》,单因素方差分析。。。
Miem 😂我可能没表述清楚,我想问的是如何从GEO下载一个dataset,然后怎么把dataset中的数据整理成类似这个表。不知道是否要用到R语言,您知道吗
GEO数据不一定有这些临床信息。
GEO官方只要求上传者必须上传样本信息(采样部位、分组情况、芯片数据),而不强制要求上传临床信息(性别、年龄、用药、TNM分期等)。
在有这些数据的前提下,如需要整理表格,可以使用R语言,也可以使用Excel、记事本等等你熟悉的文本处理软件。
我熟悉R语言,所以,我会使用R语言。