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论坛首页  >  计算机与医学、生物学软件
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手把手教你使用Imagepro-Plus(5.计数)

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这个帖子发布于15年零306天前,其中的信息可能已发生改变或有所发展。
这是该系列主题的第五个主题。在阅读此帖前,请先阅读下面的主帖。
http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=10&id=3554359&sty=1&tpg=1&age=0

其实在前面的操作中,我们经常是在计数。当我们点击count的时候,就是在计数,不过当时的主要目的不是为了计数,而是为了进行一些其他的测量。

我在实际工作中很少用这个程序来计数,原因是---不实用。这并不是软件的功能问题,而是拍摄照片的问题。因为没作过具体的计数分析,因此这一主题写起来就有点尴尬了。只能看看那些功能能用来计数吧。

最简单的数细胞的工具是measure--measurement窗口,下图中左边红线框住的工具就是计数的工具。这很象我们在镜下手工计数,认为那个地方有细胞,就在那里点一下作个标记,这样就不会重复数,也不会漏数。当图片中的细胞数目多得一眼看不出有多少个,但同时也不是多得密密麻麻的时候,比如几十个吧,用这招最简单。
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2005-06-13 11:16 浏览 : 31039 回复 : 30
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  • 2楼
好象这样计数不正规呀,最好是电脑点一下就能算出数来是最好的。那还是用count/size工具吧。
这张荧光镜下照片中细胞闪闪发亮。所以选择计数测量时可以让电脑自动选取亮物体作为识别标志。点一下automatic bright objects,再点count。调出statistics窗口就可以看到自动计数结果了。
可是它数得准确吗?有156个细胞?数多了吧?
2005-06-13 11:27
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  • 3楼
下一个招数是过滤,把错误计算进去的计数给过滤掉。
图片中的细胞都有一定大小,那些只有几个像素的小绿点显然不是一个细胞。因此可以对每个object的面积大小进行过滤,小于一定面积的就不是一个细胞。
调出count/size中的select measurement窗口,点一下中间filt range窗口中的area
再点一下下面的edit range按纽,调出来edit range窗口。
在这个窗口里上面有一个范围选择图表,表内左右两端各有一条竖线,分别是范围选择的上限和下限,可以用鼠标拖动的,把这两条线往中间拖,就减小的选择范围。此表的横坐标数是面积的象素值,纵坐标是对应像素值面积有多少个object。
图表下面有两个数值选择框,是两条选择线的具体数值,也可以在这里选择过滤数值范围。
再下面是统计数据,可以动态地看到过滤后的计数统计结果。
display filled是显示图片中的object标志的,如果选中此项,每个选中的object都显示成一个红巴巴,否则就只用边缘线框起来。
图中可以看到,如果把面积下限定到100象素,就只剩下16个细胞了。
当调整过滤数值时,图片上的object标志也会动态地显示,过滤掉的object会立即消失。
2005-06-13 12:00
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  • 4楼
还有问题。
图片中有两个细胞紧挨在一起的,被识别成一个object了。而另外还有细胞因为太暗,被识别成两个甚至更多的object了。
这只能用人工把它们分开或合并。
在count/size窗口的edit菜单下,上面的几个split命令就是用来分割连在一起的object的。
auto split 与watershed split都是自动分割,操作简单,但很少分成准确。
split是手工分割,点此后出现一个小窗口,用鼠标在相连的两个object的连接处划一条短线,将两个分开,再点一下右键就行了。把图片上所有相连的object全分割后再点一下小窗口的OK按纽。再回去count一遍,分割就生效了。
limited watershed split也是手工法分割。这种分割方法是半自动的。道理有点象涨大水。两个挨着的山峰,在山脚处是相连的,如果山下涨了洪水,这两座山峰就会彻底被水隔开了。但是水涨多高才能把两个山峰隔开呢?这个limited就是让你自己掌握涨水的程度。以便分割得更准确。按照说明书的意思,需要输入的数值是涨水最多淹没多少象素的数值。

有挨在一起的细胞,就有一个细胞被识别成两个以上object的。用手工将它们合并的命令是Draw/merge objects。这跟split的操作类似,只是不划线,而是画一个圈,把几个本应在一起的Objects围起来就行了。
2005-06-13 13:09
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