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求助：如何使用DAVID分析miRNA中的富集通路？

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楼主

两块一碗内牛满面

中医心内科

常驻站友

1楼

这个帖子发布于5年零303天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。

问题已解决悬赏丁当:5

各位前辈，之前我使用过DAVID分析mRNA的GO和KEGG，但是现在想分析一列miRNA的富集通路，但是放进去后说无法识别。
我选的是official gene symbol，难道是要选别的？miRNA的格式是miR-199a-5p，这样有问题吗？
没钱也没条件用IPA，还有别的网站或者软件可以替代的吗？有人提到GSEA，这个软件可以分析miRNA吗？

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2015-03-31 21:05 浏览 : 15150 回复 : 20

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铁杆站友

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2楼

满意答案

看过别人的论文，好像是先通过miRNA数据库找到下游的靶基因，然后对靶基因做通路分析。

2015-04-03 10:29

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• 出急诊2年遇见的最剧烈腹痛

楼主

两块一碗内牛满面

中医心内科

常驻站友

3楼

卡戎3521
看过别人的论文，好像是先通过miRNA数据库找到下游的靶基因，然后对靶基因做通路分析。

这样的啊，有具体文献吗？
这样的话，miRNA靶基因不止一个，找出来的mRNA各属不同通路的话，这样miRNA就有不同通路了？
貌似是有一定道理，但有没有理论支持或者有没有真正知道的人出来说说呢？或者有用过IPA的人出来现身说法不？

2015-04-05 16:31

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楼主

两块一碗内牛满面

中医心内科

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4楼

能有人回复不...

2015-04-07 18:03

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